Erretrobirus endogenoen detekzioa eta karakterizazioa behietan eta beste hainbat mamaliotan

  1. GARCIA ETXEBARRIA, KOLDO
Supervised by:
  1. Begoña M. Jugo Director

Defence university: Universidad del País Vasco - Euskal Herriko Unibertsitatea

Fecha de defensa: 17 June 2010

Committee:
  1. Juan Antonio Marigómez Allende Chair
  2. Asier Fullaondo Elordui-Zapaterietxe Secretary
  3. Rafael Aldabe Committee member
  4. Arcadi Navarro Cuartiellas Committee member
  5. Damián Fermín de Andrés Cara Committee member
Department:
  1. Genética, Antropología Física y Fisiología Animal

Type: Thesis

Teseo: 297192 DIALNET

Abstract

En este trabajo se han analizado los retrovirus endógenos (ERV) detectados en los genomas de varios mamíferos mediante herramientas bionformáticas. Los ERVs son elementos genómicos de origen retroviral y han sido descritos en un amplio rango de genomas de vertebrados, sobre todo en mamíferos. Sin embargo el conocimiento sobre estos elementos es limitado y los análisis genómicos realizados se han circunscrito a primates y roedores. Así, se ha realizado la identificación de ERVs en vaca y yegua, que son representantes de dos taxones (Ruminantia y Equidae) cuyos ERVs no han sido analizados a nivel genómico. También se ha estudiado la dinámica evolutiva (su proliferación y la permisividad de cambios en su secuencia) de los ERVs de estas dos especies, y para poner los resultados en contexto, se han analizado también los ERVs de otras especies, tales como, humano, chimpancé, ratón, rata y perro. Por último, en el genoma bovino, se ha analizado la expresión de ERVs utilizando las bases de datos de ESTs y se han caracterizado los genes cercanos a los ERVs.