Protein nanomechanicsfrom fast-folding proteins to microbial infections

  1. REIFS CARMONA, ANTONIO
Supervised by:
  1. David De Sancho Sanchez Director
  2. Raúl Pérez Jiménez Director

Defence university: Universidad del País Vasco - Euskal Herriko Unibertsitatea

Fecha de defensa: 21 September 2023

Type: Thesis

Teseo: 823416 DIALNET lock_openADDI editor

Abstract

Esta tesis explora los límites de la técnica de SMFS (Single-molecule force spectroscopy) AFM (atomicforce microscopy), estudiando la estabilidad mecánica de proteínas en todo su espectro, desde las lábilesproteínas de plegamiento rápido hasta las más resistentes, implicadas en procesos de infecciónmicrobianos. Utilizando este conocimiento, hemos diseñado un protocolo pionero basado en métodos demolecular docking y hight-throughput screening, utilizados habitualmente en la industria farmacéutica,para identificar moléculas con potencial mecano regulador. Estas moléculas nos permiten modular laestabilidad y el mecanismo de plegamiento de proteínas. En esta tesis también hemos iniciado eldesarrollo de una técnica que combina MT (magnetic tweezers) y bioquímica de proteínas para estudiarlas etapas iniciales de la infección bacteriana. En esta tesis, se han examinado cuatro proteínas, desde lalábil EnHD, pasando por CD4 hasta las más mecánicamente resistentes como Caf1 o FnBPA. Estasproteínas están relacionadas con procesos de infección que originan enfermedades como SIDA, peste yendocarditis. El presente trabajo conecta la nanomecánica de proteínas con importantes preguntasbiológicas, como los procesos de infección microbianos y alteraciones en la estabilidad de las proteínas.