Utilidad potencial de los genotipos de bacteriófagos f-específicos de arn para discriminar el origen de la contaminación fecal

Resumen

Este trabajo esta centrado en el estudio de los genotipos de bacteriófagos F-específicos de ARN y su utilidad potencial para discriminar el origen de la contaminación fecal (humano o no humano) en muestras ambientales. En primer lugar, se determinó el mejor método de detección tanto en lo que se refiere a la cepa huésped como al método de reconocimiento genómico para estudiar la diversidad de dichos genotipos en muestras contaminadas fecalmente. Así, se comparó la eficacia de las cepas Salmonella typhimurium WG49 y Escherichia coli HS(pFamp)R para detectar y cuantificar los diferentes genotipos de los bacteriófagos F-específicos de ARN por el método de hibridación de calvas. La sensibilidad de dicho método fue también comparada con la sensibilidad de la RT-PCR seguida por una transferencia del ADN amplificado y hibridación (Southern blot), para detectar los bacteriófagos de ARN que pertenecen al genotipo III. En segundo lugar queríamos estudiar la distribución de genotipos en muestras de ambos orígenes (humano y no humano). Por esta razón, se determinó la presencia de dichos bacteriófagos y sus genotipos de heces humanas y animales, en aguas residuales predominantemente contaminadas por excretas animales o bien humanas. Se encontraron mayoritariamente los genotipos II y III en aguas residuales de hospital y domésticas. Las aguas residuales de mataderos contuvieron mayoritariamente los genotipos I y IV. El predomiio de los genotipos II y III en aguas residuales tratadas, lo que sugiere una resistencia mayor de los genotipos I y II frente a condiciones ambientales desfavorables. Los cambios de genotipos predominantes observados en las aguas tratadas sugirieron la conveniencia de estudiar la persistencia y la resistencia de cada genotipo ante procesos de inactivación. Por ello, se comparó la resistencia a diferentes procesos de inactivación de miembros de los cuatro genotipos de baceteriófagos F-específicos d