Dinamización del diagnóstico de bacteriemias mediante el uso de nuevas tecnologías

Resumen

La sepsis, una disfunción orgánica potencialmente letal causada por una respuesta desregulada frente a una infección, es una de las entidades nosológicas con mayor morbilidad y mortalidad a nivel global. Pese a ser secundaria a una infección solo se identifica el agente causal en el 60 % de los casos y de estos hasta en un 40 % se aíslan en el torrente sanguíneo. Debido a ello, el estudio de la presencia de bacterias en la sangre, la bacteriemia, es una de las principales preocupaciones de la microbiología clínica.En este trabajo se ha desarrollado una nueva técnica de extracción bacteriana abreviada aprovechando las características líticas de algunos frascos de hemocultivos: el método Ultrarrápido o método UF. Este método ha sido empleado para la utilización de los frascos de hemocultivo positivos directamente en la identificación de los microorganismos causantes de la bacteriemia, para la realización de estudios de sensibilidad y para la realización de secuenciación de genoma completo.La espectrometría de masas y en especial el MALDI-TOF (del inglés Matrix Assisted Laser Desorption/Ionization ¿ Time Of Flight) ha supuesto una revolución en la identificación de microorganismos en microbiología, en este estudio se ha empleado el método UF para la realización de MALDI-TOF desde hemocultivos positivos con buenos resultados. El método UF ha conseguido mejores resultados que el método empleado previamente en nuestro laboratorio, el método de doble centrifugación, siendo además más económico y rápido.El método UF también ha tenido un rendimiento no inferior al método establecido previamente, el método del tubo separador de suero, para la realización de estudios de sensibilidad automatizados mediante el sistema Phoenix BD, reduciendo también el coste económico y agilizando el proceso.La secuenciación bacteriana de genoma completo permite recuperar toda la información genética contenida en una determinada cepa bacteriana. En este caso mediante el método UF se consigue obtener el material genético bacteriano presente en un hemocultivo positivo y secuenciarlo obteniendo un genoma con una calidad y cobertura suficientes para su estudio. Mediante este sistema se consigue recuperar información sobre el secuenciotipo bacteriano, los determinantes de resistencia y virulencia y las estructuras plasmídicas que permiten vehiculizarlos.