Metodes de relaxació i de difusió per a l'estudi de peptids i proteinesper rmn

Abstract

Se han desarrollado los experimentos de RMN necesarios para la adquisición eficiente de datos de relajación en moléculas marcadas selectivamente utilizando campos de confinamiento de espines débiles que cumplen la condición de Hartmann-Hahn. Las secuencias se han utilizado para la medida de parámetros de relajación a dos campos diferentes, de cuatro formas repetitivas de la molécula H-(VHLPPP)8-OH que contienen un único residuo de leucina marcado en diferentes unidades repetitivas. El análisis de los datos de relajación, utilizando diferentes modelos, permiten concluir que el comportamiento dinámico de todas las unidades repetitivas estudiadas excepto la situada en la posición N-terminal, es equivalente y no es comparable con una estructura desordenada. Se ha desarrollado un nuevo tipo de experimento llamado GAUDI que permite la medida de coeficientes de difusión traslacional a partir de experimentos 2D. Se ha propuesto un nuevo método basado en medidas de la dependencia de la velocidad de relajación transversal que permite determinar la escala de tiempo de procesos de intercambio químico entre especies que se encuentran en concentraciones marcadamente diferentes aunque la especie minoritaria no sea detectable a partir del espectro de resonancia magnética nuclear.