Structural studies of filamentous plant viruses by cryo-electron microscopy and cryo-electron tomography

  1. Cuesta Pou, Rebeca Juana
Supervised by:
  1. Mikel Valle Rodríguez Director

Defence university: Universidad del País Vasco - Euskal Herriko Unibertsitatea

Fecha de defensa: 09 September 2021

Committee:
  1. Ivan Ubarrechena Belandia Chair
  2. Ignacio Arechaga Iturregui Secretary
  3. Carmen San Martín Pastrana Committee member
Department:
  1. Bioquímica y Biología Molecular

Type: Thesis

Teseo: 156798 DIALNET lock_openADDI editor

Abstract

Los virus filamentosos flexibles de plantas representan un grupo de patógenos de plantas que causan un gran impacto económico en cultivos dedicados a la agricultura. El géneropotyvirus es el más numeroso y abarca hasta un tercio de las especies de virus conocidas.El principal objetivo de este trabajo es la obtención de más información estructural sobre los virus filamentosos flexibles de plantas, usando las metodologías de crio-microscopía electrónica (crio-ME) y crio-tomografía electrónica (crio-TE).En éste trabajo, la estructura del virus del mosaico del nabo (Turnip mosaic virus, TuMV) ha sido resuelta a 5 Å mediante crio-ME, así como la estructura de sus partículas como virus (Viral like particles, VLPs) a resoluciones entre 7 y 8 Å. Mediante crio-TE se ha explorado la estructura de los extremos de los filamentos, encontrando dos estructuras diferenciadas, una con forma de hélice y otra con un final plano con una densidad alargada adicional que podría pertenecer a otra proteína potyviral, la VPg.Finalmente, se ha realizado la búsqueda de compuestos químicos que interaccionan al bolsillo de unión de la proteína de la cápside con el ssRNA mediante técnicas de resonancia magnética nuclear (RMN) y se estudió la naturaleza de la interacción mediante crio-ME.