Analysis of selection on target genes for keratinocyte exosome miRNAs in relation to human melanogenesis

Resumen

Actualmente, los exosomas se definen como un tipo de vesícula extracelular con un diámetro entre 20 y 100 nm, cuyo origen no es del todo conocido, y que pueden transportar una amplia serie de moléculas como mRNAs, miRNAs, proteínas citoplásmicas y de membrana, etc. Recientemente se ha empezado a estudiar su implicación y la de su contenido, en la comunicación intercelular entre queratinocitos y melanocitos durante la melanogenesis. Así, LoCicero et al. (2015) identificaron un conjunto de miRNAs, transportados por exosomas queratinocíticos, que regulaban la expresión de genes diana de melanocitos. El objetivo principal de este trabajo fue identificar genes diana para estos miRNAs que estuviesen bajo selección y, además, relacionados con la pigmentación. Para ello, hemos predicho estos genes computacionalmente mediante software como Diana Tools y miRDB y, estos se procesaron posteriormente. Los haplotipos de los genes diana se obtuvieron de la base de datos 1000 Genomes Project para poblaciones africanas y europeas. Los genes fueron sometidos al test de Tajima, D para evaluar el efecto de la selección sobre ellos. Ciertos genes implicados en pigmentación o en melanoma, demostraron estar bajo selección purificadora. Resulta de especial interés el ERCC6, que codifica para un complemento importante del complejo de reparación por escisión de nucleótidos, que es regulado por la luz UV, y que muestra el efecto de la selección en la población africana. Además, una región dentro del ERCC6, que coincide con los exones 11 y 12 del gene y que posee un lugar de unión para el factor de transcripción c-Fos, demuestra los valores más altos de selección. Este factor de transcripción se ha visto implicado tanto en la regulación de la melanogénesis como en el proceso de reparación del ADN dañado por la luz UV (Tomicic et al. 2011; Torres et al. 2013).