Variabilidad genética de alteromonas macleodii mediante mlsa. Comparación genómica de las cepas altde y atcc 27126

Resumen

Esta tesis consta de dos partes. En la primera se realiza un estudio de biogeografía de la bacteria marina de vida libre Alteromonas macleodii mediante el uso de la técnica (multilocus sequence análisis) o MLSA. Se usan un conjunto de nueve marcadores genéticos con la finalidad de distinguir entre 23 aislados de la bacteria, pudiéndolos diferenciar entre tres ecotipos: ecotipo de superficie, ecotipo del mar negro y ecotipo de profundidad. La segunda parte consiste en un estudio de genómica en el que se describe el genoma de AltDE, aislado a 1000 m de profundidad en el Mediterráneo y el genoma de ATCC 27126 aislada en aguas superficiales. Ambos genomas se comparan entre si y con la base de datos GOS (global ocean sampling). Observándose que el factor clave de adaptación a los diferentes ecotipos no era solo la profundidad, si no un posible estilo de vida agregado a particulas.