Molecular genetic diagnosis of patients from the Basque Country with inherited retinal dystrophies

  1. EZQUERRA INCHAUSTI, MAITANE
Supervised by:
  1. David Otaegui Bichot Director
  2. Ana María Zubiaga Elordieta Director
  3. Javier Ruiz Ederra Director

Defence university: Universidad del País Vasco - Euskal Herriko Unibertsitatea

Fecha de defensa: 25 January 2019

Committee:
  1. Guillermo Antiñolo Gil Chair
  2. Aritz Irizar Aguirre Secretary
  3. Marian Martínez de Pancorbo Gómez Committee member
Department:
  1. Genética, Antropología Física y Fisiología Animal

Type: Thesis

Teseo: 148729 DIALNET lock_openADDI editor

Abstract

Las distrofias hereditarias de la retina (DHR), son un grupo heterogéneo de enfermedades de distintosfenotipos clínicos que afectan principalmente a la retina. Existen más de 250 genes ligados a más de 20fenotipos distintos. El avance en las técnicas de secuenciado ha permitido diagnosticar molecularmente acada vez más pacientes, de una manera más rápida y precisa, a pesar de lo cual, el porcentaje de casos sinresolver sigue siendo alto.A lo largo de la presente tesis, nos planteamos realizar la caracterización genético-molecular de lapoblación de pacientes con DHR de Euskadi mediante distintas técnicas y poder implementar así un flujode trabajo para poder llevarlo a cabo. Para ello, en este trabajo hemos utilizado distintas estrategias. Porun lado, se ha utilizado la tecnología de NGS. Utilizamos dos paneles: 1) genes con herencia autosómicadominante, en el que se analizaron pacientes con sospecha de herencia dominante de formaindividualizada y 2) 316 genes de diversas patologías oftalmológicas, incluidas las DHR descritas hasta elmomento, en el que se analizaron muestras agrupadas en pool de pacientes con todos los tipos deherencia. También hemos secuenciado el exoma completo (WES), para detectar alteraciones en genes noasociados previamente a DHR, y arrays CGH y MLPA para detectar cambios en el número de copias,tanto de genes asociados como no asociados previamente a DHR. Con el uso de todas estas técnicas,durante esta tesis, hemos podido diagnosticar molecularmente a 61 pacientes de un total de 143 pacientesanalizados.