Determinación estructural de virión del virus del mosaico de la sandia por crío-microscopía electrónica

  1. ZAMORA PORRAS, MIGUEL
Supervised by:
  1. Mikel Valle Rodríguez Director
  2. Arturo Muga Villate Director

Defence university: Universidad del País Vasco - Euskal Herriko Unibertsitatea

Fecha de defensa: 14 September 2018

Committee:
  1. Alicia Alonso Izquierdo Chair
  2. Nicola G.A. Abrescia Secretary
  3. Carmen San Martín Pastrana Committee member
Department:
  1. Bioquímica y Biología Molecular

Type: Thesis

Teseo: 147687 DIALNET lock_openADDI editor

Abstract

Los virus filamentosos flexibles constituyen uno de los mayores grupos de patógenos de plantas con un impacto en la agricultura muy relevante. Estos virus con genoma (+)ssRNA presentan viriones filamentosos flexibles con estructura helicoidal. En este trabajo hemos determinado la estructura a alta resolución del virión de un miembro de este grupo, el Virus del mosaico de la sandía (WMV) (familia Potyviridae) por crio-microscopía electrónica. La estructura obtenida para la proteína de la cápsida (CP) de WMV muestra un plegamiento muy similar a los miembros con estructura disponible de la familia Alphaflexiviridae y revelan un sitio de unión al RNA genómico del virus idéntico en ambas familias. El análisis de las secuencias consenso para las CPs de las distintas familias de virus filamentosos flexibles muestra la existencia de tres residuos conservados en la zona de unión con el RNA. Conjuntamente, estos resultados indican un plegamiento común para las CP de las distintas familias de este grupo de virus y la existencia de una diana para el diseño de compuestos antivirales.Anteriormente se había descrito la similitud estructural entre las CPs de los miembros descritos de la familia Alphaflexiviridae y algunas nucleoproteínas (NP) de virus ssRNA que infectan animales (gen. Phlebovirus). La CP de WMV también presenta homología estructural con las nucleoproteínas de estos virus pero además también con las NPs de miembros de la familia Orthomyxoviridae. Estos resultados sugieren la existencia de una relación evolutiva entre los virus filamentosos flexibles (+)ssRNA y los virus (-)ssRNA patógenos de animales y plantas.