Regulación transcripcional de snd1 en condiciones inflamatorias y análisis chip-on-chip de sus genes diana/transcriptional regulation of snd1 under inflammatory conditions and chip-on-chip analysis of

  1. ARRETXE OLIDEN, ENARA
Supervised by:
  1. Yolanda Chico Carmona Director
  2. María José Martínez San Pelayo Director

Defence university: Universidad del País Vasco - Euskal Herriko Unibertsitatea

Fecha de defensa: 09 July 2013

Committee:
  1. Begoña Ochoa Olascoaga Chair
  2. José Ignacio Ruíz Sanz Secretary
  3. Olli Silvennoinen Committee member
  4. Ainhoa Ruiz del Agua Committee member
  5. Kathleen M. Botham Committee member
Department:
  1. Fisiología

Type: Thesis

Teseo: 116079 DIALNET

Abstract

SND1 o Tudor-SN, es una proteína multifuncional que regula la expresión génica como coactivador transcripcional y a nivel post-transcripcional; además juega un papel en la carcinogénesis, en procesos secretores y en la biología de los cuerpos lipídicos en esteatosis hepática. Actualmente, SND1 está despertando interés como posible diana terapéutica debido a su sobrexpresión en células tumorales. Considerando la trascendencia de conocer cómo se controla la expresión de SND1, y su papel como coactivador transcripcional, en el presente trabajo abordamos el estudio de su regulación transcripcional en condiciones inflamatorias y de los genes diana de esta proteína. Se han identificado sitios de unión a los factores de transcripción NF-¿B y a STAT3 en los promotores de los genes SND1 humano y SNDp102 de rata. Las citoquinas proinflamatorias TNF-¿ e IL-6 estimulan la actividad transcripcional del promotor de SND. Los resultados obtenidos mediante ensayos EMSA, de inmunoprecipitación de cromatina y mutagénesis dirigida, indican que los efectos de TNF-¿ e IL-6 sobre SND1 están mediados en parte por NF-¿B y a STAT3. Por otro lado, se ha caracterizado mediante ChIP-on.chip la unión de SND1 a un número considerado de promotores génicos, estas uniones tienen lugar en la mayoría de los casos en cera del inicio de la transcripción. Se han validado como genes diana de SND1 varios genes relacionados con el metabolismo lipídico, la transcripción, la diferenciación y la regulación del ciclo celular. En respuesta a TNF-¿, se alteran los niveles de mRNA de algunos de los genes diana de SND1 relacionados con el metabolismo lipídico. Resulta de especial interés que SND1 se une a su propio promotor solamente en células HepG2 estimuladas con TNF-¿.