ADNmtCaracterización de razas bovinas y ovinas autóctonas del País Vasco e identificación de especies animales de interés económico y forense

Abstract

El ADN mitocondrial (ADNmt) es un marcador molecular de gran interés en áreas como la genética forense, la ecología o la seguridad alimentaria. La longitud e información del ADNmt es muy reducida en comparación con el ADN nuclear, pero eso no implica una ausencia de importancia biológica, ya que contiene información esencial con un interés especial para la asignación de linajes maternos y la determinación de especies, entre otros.El presente trabajo se ha centrado en el análisis de dos regiones del ADNmt en diferentes especies animales; la región control, para el análisis de los linajes maternos de individuos de las especie Bos taurus y Ovis aries autóctonos del País Vasco, tanto en épocas prehistóricas como actuales, y la región del gen citocromo b (cyt b), utilizada para la identificación de especies de animales vertebrados y artrópodos.Los linajes maternos tanto bovinos como ovinos han sido ampliamente estudiados en Europa. La separación, geográfica y cultural de las especies ganaderas autóctonas del País Vasco en el marco de la Península Ibérica, ha motivado la hipótesis de una particularidad genética de estas razas. No obstante, en la actualidad existen muy pocos estudios genéticos sobre las razas bovinas Terreña y Pirenaica y de óvidos de raza Latxa. Con el objetivo de profundizar en el estudio del acervo genético mitocondrial de las mencionadas razas autóctonas, se ha estudiado la región control de 155 bóvidos de las razas Terreña y Pirenaica y 174 óvidos de raza Latxa. Los resultados de los linajes de estas razas autóctonas vascas indican la predominancia del haplogrupo T3 en el caso de las vacas y del haplogrupo B en el caso de las ovejas, mostrando cierta similitud con el acervo genético descrito para las mismas especies en otras regiones de Europa. Sin embargo, se ha podido observar la particularidad de la cabaña autóctona del País Vasco al hallarse singularidades genéticas destacables. En el caso de las vacas se encontraron tres individuos pertenecientes al haplogrupo Q, extremadamente raro y hasta el momento únicamente presente en vacas italianas y egipcias. En el caso de las ovejas se encontraron dos animales con un motivo de repetición en tándem extra de 75/76 pb en la región control ETAS1 del ADNmt, otra particularidad extremadamente rara, ya que solo se han encontrado otros 33 animales con esta característica en el mundo y ninguno de ellos habita en el oeste de Europa.Las razas autóctonas del País Vasco posiblemente son descendientes directos de los primeros animales domesticados introducidos en la Península durante el proceso de neolitización y por tanto probablemente adaptadas al medio en el que habitan desde hace miles de años. El estudio del acervo genético de 14 animales prehistóricos y su comparación con 329 animales actuales (155 bóvidos y 174 óvidos) ha permitido determinar la existencia de continuidad genética entre los animales prehistóricos y los actuales de la región del País Vasco.Por otro lado, la identificación genética de especies es de gran interés principalmente en el campo de la genética forense y la seguridad y calidad alimentaria. El gen mitocondrial cyt b es uno de los genes más estudiados con fines identificativos, junto con los también genes mitocondriales citocromo c oxidasa subunidad 1 (COI), 12s RNA y 16s RNA. Pero el cyt b es sin duda el marcador más utilizado en el campo de la genética forense debido a que proporciona una reconstrucción muy exacta de la filogenia.El método más común para la identificación genética de especies consiste en utilizar cebadores universales de genes especie-específicos que permiten la amplificación mediante PCR del ADN de un gran número de especies. Los cebadores universales más ampliamente utilizados hasta la fecha tienen la limitación de que los fragmentos que amplifican son muy largos y por ello, no resulta posible amplificar adecuadamente los fragmentos de ADN altamente degradados que son frecuentemente hallados en muestras forenses. Por lo que en el presente estudio se ha diseñado y comprobado experimentalmente una pareja de cebadores universales capaces de amplificar una región de 148 pb del gen cyt b en 63 especies pertenecientes a 38 Familias de 14 Ordenes y 5 Clases diferentes. Este mismo par de cebadores también han sido utilizados para crear una aplicación de cribado (en adelante screening), mediante la metodología de disociación de alta resolución (HRM), capaz de identificar especies animales cárnicas y cinegéticas mediante diferentes paneles de disociación.