Implementation of computational techniques to study protein synthesis and folding

Résumé

El proceso de síntesis de las proteínas es un proceso fundamental en biología del que se tiene una descripción fenomenológica, pero que en la mayoría de los casos, los mecanismos a nivel atómico son una incógnita. Uno de las herramientas para estudiar este proceso es la dinámica molecular, la cual consiste en obtener una evolución temporal del sistema resolviendo las ecuaciones de Newton. Mediante esta técnica es posible simular partes de este proceso, aunque de manera muy limitada. En esta tesis se han llevado a cabo simulaciones de canales íónicos en varios puntos de su síntesis, con el fin de describir en la medida de lo posible, parte de este complejo problema.