Development of techniques for the analysis of acetic acid bacteria populations and their interaction in different food environments

  1. Valera Martínez, María José
Dirigée par:
  1. Albert Mas Barón Directeur/trice
  2. Estíbaliz Mateo Alesanco Directeur/trice

Université de défendre: Universitat Rovira i Virgili

Fecha de defensa: 11 novembre 2014

Jury:
  1. Isidoro García García President
  2. José Manuel Guillamón Navarro Secrétaire
  3. Maria Gullo Rapporteur

Type: Thèses

Teseo: 374559 DIALNET lock_openTDX editor

Résumé

El desenvolupament de tècniques moleculars per a la detecció, identificació i tipificació de bacteris acètics és la clau per a un millor enteniment de la coexistència d’aquesta microbiota relacionada amb productes alimentaris. S’han aplicat diferents tècniques dependents e independents de cultiu per a la identificació i quantificació de bacteris acètics que es troben en raïm i vi procedents de les Illes Canàries, així com en biofilm de vinagre de maduixa. Es van detectar espècies i generes de bacteris acètics que no s’havien descrit prèviament en aquests nínxols ecològics. El disseny d’encebadors específics i sondes TaqMan-MGB en la regió del espaiador intergènic (ITS) entre els gens 16S-23S rRNA va permetre la detecció de dues espècies molt relacionades com són Acetobacter malorum i Acetobacter cerevisiae mitjançant l’ús de PCR en temps real. L’ús d’encebadors degenerats va fer possible la detecció de la presencia del gen que codifica la cel•lulosa sintasa i correlacionar aquest gen amb el fenotip de producció de cel•lulosa en bacteris acètics de diferents espècies. D’altra banda, l’escombratge funcional realitzat sobre el genoma de Komagataeibacter europaeus Gae02 va permetre la detecció de una proteïna, amb seqüència homòloga a la activitat prefenat deshidratasa, que va presentar activitat “quorum quenching”.