Clpb dynamics and functional versatility

Résumé

El sistema bichaperona ClpB-DnaK forma parte de la red de control de calidadproteico celular. Su acción conjunta permite la desagregación y reactivación deagregados proteicos formados en condiciones de estrés. ClpB es una proteínahexamérica altamente dinámica y capaz de intercambiar subunidades entre distintoshexámeros. En la presente tesis se ha caracterizado la dinámica de ClpB en presencia delos distintos ligandos que forman parte de su ciclo funcional. Elensamblaje/desensamblaje de la proteína está regulado por su actividad ATPasa: launión de ATP estabiliza el hexámero mientras que el ADP favorece sudesoligomerización. El sistema DnaK y aún más los complejos DnaK-agregadoestimulan la dinámica de ClpB a través de la activación de su actividad ATPasa. Elaumento en la dinámica de ClpB está relacionado con un incremento en la eficiencia desu actividad desagregasa. La habilidad de ClpB de intercambiar subunidades puede serutilizada como herramienta para generar hexámeros híbridos compuestos porsubunidades salvajes y mutantes de la proteína. Estos hexámeros permiten estudiar lascomunicaciones intermonoméricas que regulan la actividad de la misma. Lacaracterización funcional de heterohexámeros formados por subunidades salvajes ysubunidades mutadas en sus dos NBDs, capaces de unir pero no de hidrolizar ATP,indican que ClpB es una proteína versátil capaz de adaptar su mecanismo decomunicación intermonomérica al tipo de sustrato que deba procesar. Esta adaptación esdependiente de su dominio M y de la naturaleza del sustrato.